Continuando a viagem pelas Ilhas Decolore a caminho da Região de Kanto, nossos heróis estão explorando uma parte árida e rochosa da Ilha Extensia.
Após eles montarem acampamento para passarem a noite, Pikachu e Axew são acordados pelo Pokémon Mítico Jirachi! Dizem que Jirachi desperta por sete dias a cada mil anos. Enquanto Pikachu e Axew brincam com Jiracho, o barulho acorda nossos heróis, e quando Ash percebe o que ele está vendo, ele fica tão empolgado que corre para fazer amizade com ele... assustando Jirachi com isso.
Na manhã seguinte, enquanto Ash, Cilan e Iris conversam sobre terem visto Jirachi, uma garota chamada Gemma chega correndo e pede a eles que digam para onde ele foi. Acontece que ela quer encontrar Jirachi desesperadamente para que ele realize o desejo dela: restaurar a montanha onde ela mora para que volte a ser verde e viçosa.
Mais tarde, enquanto conhecem a mãe de Gemma, nossos heróis descobrem que o marido dela está fora em uma jornada há quase 2 anos, tentando descobrir por que a montanha está seca e tornou o lugar árido. Uma das muitas razões para Gemma estar tão desesperada para ter seu desejo realizado é fazer com que o pai dela volte para casa!
Com apenas sete dias antes de Jirachi voltar a dormir por mais mil anos, Ash e seus amigos se oferecem para ajudar Gemma a encontrar o ardiloso Pokémon e realizar seu desejo. A primeira vez que eles o encontram, eles se aproximam muito rapidamente e ele foge. Mas eles continuam procurando, dia após dia e eles não são os únicos. Jessie, James e Meowth também querem colocar as mãos no Pokémon Mítico!
Finalmente, no sétimo dia, eles encontram Jirachi de novo, e desta vez, Gemma mantém a calma. Quando ela pede para que ele realize seu pedido, Jirachi concorda e é pego pela Equipe Rocket! Mas com a bravura de Gemma, as habilidades de batalha de nossos heróis e o incrível poder de Jirachi fazem com que Jirachi seja libertado e mandam a Equipe Rocket decolar mais uma vez.
Jirachi está exausto e ferido pela prova difícil que passou. O pai de Gemma chega e os leva para o Santuário da Montanha onde Gemma faz um novo pedido: ela só quer que Jirachi fique bem. O pedido dela é realizado, e enquanto Jirachi recupera a energia, a água começa a fluir de novo de dentro da montanha. A família de Gemma está reunida, a montanha está começando a se revitalizar, e Jirachi volta a dormir por mais mil anos enquanto nossos heróis continuam a jornada.