Enquanto a Equipe Plasma continua a implantar seu plano diabólico de roubar a Pedra de Luz e prender N; Cilan e Iris estão batalhando duro, enquanto Ash e N estão presos no subterrâneo. N consegue sentir a perturbação na superfície, já que ele ouve as vozes interiores de seus amigos Pokémon chorando de desespero. Ash decide que eles têm que sair de lá e ajudar, e menciona uma das regras de aventura do Professor Cedric Juniper: Nunca desista até terminar! E enquanto N assiste surpreso, Ash chama seus Pokémon do repouso, e eles todos trabalham juntos para cavar um túnel até a superfície e N fica maravilhado com o vínculo entre eles.
Enquanto isso, lá em cima, Colress ativa de novo seu dispositivo de controle Pokémon, forçando Cilan e Iris a chamarem de volta Crustle e Dragonite para suas Pokébolas assim a máquina não poderá controlá-los. Isso os deixa vulneráveis, e a Equipe Plasma entra nessa para capturá-los! Aldith quer que Colress mande os Pokémon controlados para o subterrâneo atrás dos alvos deles – e bem na hora, Krookodile rompe o chão, seguido rapidamente por Charizard, Ash, e N que está segurando a Pedra de Luz!
Colress redireciona seus dispositivo sobre os Pokémon de Ash, e Ash luta para retorná-los todos em segurança... com exceção de Pikachu, que tem uma aversão à sua Pokébola. A máquina de Colress assume o controle, e um Pikachu rosnando começa a atacar nossos heróis. Ash gentilmente tenta fazer seu melhor amigo reconhecê-lo, mas não funciona, e Pikachu dispara um Choque do Trovão super poderoso à queima-roupa em Ash, deixando-o inconsciente.
Desesperadamente, N se oferece para se entregar, juntamente com a Pedra de Luz, se Colress desligar o dispositivo e libertar Pikachu. Barret concorda, N é feito prisioneiro da Equipe Plasma e Pikachu volta a si e acaricia Ash que está ferido.
Ghetsis logo chega e revela seu principal objetivo: despertar o Lendário Pokemon Rershiram da Pedra de Luz e assumir o controle de sua mente! Nossos heróis conseguirão deter o esquema do vilão antes que seja tarde demais?
