Enquanto Ash está fazendo um treinamento especial na casa de Cynthia preparando-se para a Liga Unova, os vilões da Equipe Rocket estão terminando os preparativos para dispararem seu último esquema diabólico: A Operação Tempestade!
Após assistir a um treino de batalha, Meloetta entra em ação! Ash e Krookodile haviam acabado de aceitar o desafio de Meloetta quando um enorme Golurk desce sobre o campo de batalha, seguido por seu Treinador, Ridley que imediatamente acusa Ash de ser um vilão e sequestrar Meloetta! O mal-entendido rapidamente é resolvido e Ridley explica que ele é um dos protetores de Meloetta e que ele e Golurk têm procurado pelo Pokémon Mítico há um bom tempo depois dela ter sido levada por vilões desconhecidos. Os vilões em questão rapidamente se tornam conhecidos: um par de agentes da Equipe Rocket seguiu Meloetta até a casa de Cynthia tentando recapturá-la! Ridley diz que ele e Golurk irão batalhar contra eles enquanto Ash e os outros tiram Meloetta de lá e fogem, mas o caminho deles logo é bloqueado por Jessie, James e Meowth!
Iris e Cilan se põem contra eles enquanto Ash, Pikachu e Meloetta continuam. Infelizmente, o plano deles cai bem nas mãos da Equipe Rocket e o chefe está esperando para prendê-los! Giovanni e seu Persian aprisionam Ash e Pikachu em uma jaula e ordenam que Meloetta se renda ou assista aos amigos sofrerem. Meloetta não tem escolha e os três são levados no helicóptero da Equipe Rocket e depois transferidos para um submarino que desce até as ruínas de um templo no fundo da Baía Undella.
Ash assiste impotente enquanto Meloetta está presa dentro do templo. O Doutor Zager começa a rodar uma gravação da perseguida canção de Meloetta, que em seguida destranca um lacre antigo, transformando o templo e o fazendo subir até a superfície da baía. Assim que o caminho fica livre, Giovanni vai para a parte mais secreta do templo e reivindica o Espelho Revelador, um espelho místico com poderes desconhecidos! Sobre o que realmente é a Operação Tempestade? Será essa a maior ameaça que a Região de Unova já enfrentou?
